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亞硫酸氫鈉修飾基因組DNA
如不特別指出,所用雙蒸水(ddH2O)均經(jīng)高壓蒸汽滅菌。
1、將約2μgDNA于1.5mlEP管中使用ddH2O稀釋至50μl;
2、加5.5ul新鮮配制的3M NaOH;
3、42℃水浴30min;
以下步驟在水浴期間配制:
4、10mM 對(duì)苯二酚(氫醌),加30μl至上述水浴后混合液中(溶液變成淡黃色);
5、3.6M 亞硫酸氫鈉(Sigma,S9000),配制方法:1.88g亞硫酸氫鈉使用ddH2O稀釋,并以3M NaOH滴定溶液至PH 5.0,最終體積為5ml。這么大濃度的亞硫酸氫鈉很難溶,但加入NaOH后會(huì)慢慢溶解,需要有耐心。PH一定要準(zhǔn)確為5.0。加520μl至上述水浴后溶液中;
6、EP管外裹以鋁箔紙,避光,輕柔顛倒混勻溶液;
7、加200μl石蠟油,防止水分蒸發(fā),限制氧化;
8、50℃避光水浴16h。
這一步需要注意的細(xì)節(jié):
1、基因組DNA的量不需十分精確,寧多勿少,因?yàn)樵谝院蠹兓厥詹襟E中會(huì)有丟失,且此方法修飾最多可至4μg;
2、所有試劑均須新鮮配制,所以配液的技術(shù)要過(guò)關(guān),既要快,又要精確;
3、亞硫酸氫鈉溶液呈強(qiáng)酸性,一定用堿將PH調(diào)制5.0,否則PH不合適會(huì)影響后續(xù)純化吸收;
4、水浴最好達(dá)16小時(shí),雖可以短至8小時(shí),但后者修飾會(huì)有不完全。







