通過DNA 測序對微生物進行物種鑒定（菌種鑒定）是比傳統生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA 測序不依賴菌種本身特點，對所有菌種均可使用。比傳統生化鑒定更加快速，準確。麟美生物提供的微生物物種鑒定服務包括細菌16s rDNA鑒定和真菌26s rDNA鑒定、真菌ITS和真菌18s 鑒定。

提供樣品

      基因組DNA：濃度≥ 10 ng/μl，總體積≥ 20 μl，革蘭氏陽性細菌由于細胞壁較厚，最好提供基因組DNA；

      帶有單菌落的平板或斜面：應長有至少分離三次以上的單菌落。

交付報告

      PCR 產物照片；

      菌種鑒定NCBI 參考結果；

      測序彩色波形圖；

      測序方向圖；

      序列堿基圖。

16S DNA測序技術服務

技術原理

16S rDNA為編碼原核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列，具有10個保守區和9個高變區，其中保守區在細菌間差異不大，高變區具有屬或種的特異性，隨親緣關系不同而存在差異。16S rDNA擴增子測序，通常是選擇1-2個高變區，利用保守區設計通用引物進行PCR擴增，再對高變區進行測序分析和菌種鑒定。16S rDNA擴增子測序技術是研究環境樣品中微生物群落結構組成、挖掘樣品之間差異的重要手段。

16S rDNA結構示意圖

16S rDNA常用引物

實驗路線

   為提高數據的利用效率，擴增子通常進行混樣建庫，為此需要在上下游引物的5’端加6-8個堿基的barcode序列，用于區分不同的樣品；PCR產物檢測合格后，等質量混合到一起，構建PCR-free文庫并上機測序。

技術路線

樣本要求

   注：擴增子測序結果的準確性受DNA質量影響較大，所以前期樣本采集的過程一定要保證快速和低溫環境，提取過程也要確保DNA的完整性和提取量。

實驗周期 

  樣本質檢合格后，22個工作日。